特级丰满少妇一级AAAA爱毛片,亚洲AV无码专区一级婬片毛片,真实的国产乱ⅩXXX实拍,中文字幕一区二区三区四区,国产成人无码91精品一区69

 分類: 醫(yī)學(xué)研究

一般做完RNA的差異表達(dá)分析后,會有一堆的結(jié)果與數(shù)據(jù)。那么,怎么樣讓你的分析結(jié)果在paper中以更加直觀形象(好看炫酷)的方式展示出來呢?

前面我們講過熱圖函數(shù)pheatmap()參數(shù)講解。下面我們介紹另外一種展示方式:火山圖(Volcano Plot)。

首先,我們要注意兩個重要概念:

FDR(False Discovery Rate)

在差異表達(dá)分析過程中,采用統(tǒng)計學(xué)方法對原有假設(shè)檢驗得到的p值進(jìn)行校正,并最終采用校正后的p值,即為FDR。

FC(Fold Change)是兩個/組樣品間基因表達(dá)水平的比值,是表示差異倍數(shù)的變量。

一般差異表達(dá)分析中會同時控制這兩個參數(shù)來篩選顯著差異表達(dá)基因,如取FDR<0.05和FC≧2。火山圖可以直觀地展現(xiàn)所有基因的FDR與Fold Change之間的關(guān)系,以便快速查看基因在兩組樣品間表達(dá)水平的差異程度和其統(tǒng)計學(xué)顯著性?;鹕綀D的本質(zhì)其實就是散點圖。橫坐標(biāo)表示某一個基因在兩樣品中表達(dá)水平差異倍數(shù)的對數(shù)值,即log2(FC);橫坐標(biāo)絕對值越大,說明基因表達(dá)量在兩樣品間的倍數(shù)差異越大。縱坐標(biāo)表示FDR的負(fù)對數(shù)值,即-log10(FDR)??v坐標(biāo)值越大,表明差異表達(dá)越顯著,篩選得到的差異表達(dá)基因越可靠。下面,小編就手把手教你如何繪制火山圖啦。

第1步? 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

差異表達(dá)分析結(jié)果數(shù)據(jù)示例:第一列為基因名稱,第二列為差異表達(dá)分析算法得到的p值,第三列為矯正后的p值,即FDR,第四列為log2FC值。繪制火山圖只需要最后兩列就行。

數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

gene_symbol PValue FDR log2FC
RAB22A 0.731093877 ?0.915536119 ?-0.043559185
DDX20 0.455372338 ?0.779014647 ?-0.099300804
CILP2 0.415756716 ?0.749566482 1.420386794
項目 #4 0.003274032 ?0.056770217 6.182603532
RP11-618P17.4 0.351633414 ?0.709160705 -0.108742132

第2步? R代碼畫圖

 

最后繪制出來的火山圖如下,是不是比干巴巴地在文章里面貼一個差異表達(dá)分析結(jié)果的表格好看多了?

注:

一個點表示一個基因, 橫坐標(biāo)表示某一個基因在兩樣品中表達(dá)水平差異倍數(shù)的對數(shù)值;縱坐標(biāo)表示FDR的負(fù)對數(shù)值。橫坐標(biāo)絕對值越大,說明基因在兩樣品間的表達(dá)水平倍數(shù)差異越大;縱坐標(biāo)值越大,表明差異越顯著,篩選得到的差異表達(dá)基因越可靠。圖中綠色的點代表表達(dá)下調(diào)基因, 紅色的點代表表達(dá)上調(diào)基因, 黑色代表非差異表達(dá)基因。

點擊按鈕,獲取設(shè)計思路方案

百邁客云

關(guān)注百邁客云,隨時隨地學(xué)習(xí)

?
最近文章
www.精品视频.com | 人妻激情偷乱视91九色 | 精品人妻少妇无码系列 | 一级毛片在线免费观看 | 丰满少妇A片免费观看 | 人妻少妇被猛烈进入中文字幕 | 乱伦小说与照片电影一区二区三区 | 红桃视频无码中文精品 | 伊人久久免费视频 | 男女视频久久蜜乳91 | 四季岛国AV无码一区 | 无毛国产aaaaaa | 亚洲无码人妻一区二区 | 精品国产1区2区3区 富婆一区二区三区91 | 熟女系列—91Porn | 蜜臀在线播放一区在线播放 | 国产孕妇A片婬片www | 好屌色在线视频免费看 | 高清无码乳房免费观看 | 特黄AAAAA免费A片毛多水多 | 中文字幕免费网站 | 不卡毛无套内射久久不 | 人妻少妇精品久久久久久久 | 国产1区2区3区中文字幕 | 少妇看黄色一级二级性生活高朝 | 午夜成人电影在线观看 | 成人黄色视频在线观看免费 | ww黄网站在线观看免费 | 四川一级毛片免费观看 | 少妇喷潮 固产 | 少妇搡BBBB搡BBB搡AA | 久久久波德野结依AV再现! | 国产综合在线视频 | 强制高潮(H)调教视频 | 人妻人人澡人人添人人爽第02集 | 性欧美婬妇ⅹXXX视频 | 乱熟女高潮一区二区三肖椒 | 欧美人妻精品久久久久久 | 初中麻豆啪啪啪黑丝免费 | 亚洲中文久久精品无码比基尼 | 欧美丰满少妇东北少妇 |