特级丰满少妇一级AAAA爱毛片,亚洲AV无码专区一级婬片毛片,真实的国产乱ⅩXXX实拍,中文字幕一区二区三区四区,国产成人无码91精品一区69

 分類: 醫(yī)學(xué)研究

一般做完RNA的差異表達(dá)分析后,會有一堆的結(jié)果與數(shù)據(jù)。那么,怎么樣讓你的分析結(jié)果在paper中以更加直觀形象(好看炫酷)的方式展示出來呢?

前面我們講過熱圖函數(shù)pheatmap()參數(shù)講解。下面我們介紹另外一種展示方式:火山圖(Volcano Plot)。

首先,我們要注意兩個重要概念:

FDR(False Discovery Rate)

在差異表達(dá)分析過程中,采用統(tǒng)計學(xué)方法對原有假設(shè)檢驗得到的p值進(jìn)行校正,并最終采用校正后的p值,即為FDR。

FC(Fold Change)是兩個/組樣品間基因表達(dá)水平的比值,是表示差異倍數(shù)的變量。

一般差異表達(dá)分析中會同時控制這兩個參數(shù)來篩選顯著差異表達(dá)基因,如取FDR<0.05和FC≧2。火山圖可以直觀地展現(xiàn)所有基因的FDR與Fold Change之間的關(guān)系,以便快速查看基因在兩組樣品間表達(dá)水平的差異程度和其統(tǒng)計學(xué)顯著性?;鹕綀D的本質(zhì)其實就是散點圖。橫坐標(biāo)表示某一個基因在兩樣品中表達(dá)水平差異倍數(shù)的對數(shù)值,即log2(FC);橫坐標(biāo)絕對值越大,說明基因表達(dá)量在兩樣品間的倍數(shù)差異越大。縱坐標(biāo)表示FDR的負(fù)對數(shù)值,即-log10(FDR)??v坐標(biāo)值越大,表明差異表達(dá)越顯著,篩選得到的差異表達(dá)基因越可靠。下面,小編就手把手教你如何繪制火山圖啦。

第1步? 數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

差異表達(dá)分析結(jié)果數(shù)據(jù)示例:第一列為基因名稱,第二列為差異表達(dá)分析算法得到的p值,第三列為矯正后的p值,即FDR,第四列為log2FC值。繪制火山圖只需要最后兩列就行。

數(shù)據(jù)準(zhǔn)備

gene_symbol PValue FDR log2FC
RAB22A 0.731093877 ?0.915536119 ?-0.043559185
DDX20 0.455372338 ?0.779014647 ?-0.099300804
CILP2 0.415756716 ?0.749566482 1.420386794
項目 #4 0.003274032 ?0.056770217 6.182603532
RP11-618P17.4 0.351633414 ?0.709160705 -0.108742132

第2步? R代碼畫圖

 

最后繪制出來的火山圖如下,是不是比干巴巴地在文章里面貼一個差異表達(dá)分析結(jié)果的表格好看多了?

注:

一個點表示一個基因, 橫坐標(biāo)表示某一個基因在兩樣品中表達(dá)水平差異倍數(shù)的對數(shù)值;縱坐標(biāo)表示FDR的負(fù)對數(shù)值。橫坐標(biāo)絕對值越大,說明基因在兩樣品間的表達(dá)水平倍數(shù)差異越大;縱坐標(biāo)值越大,表明差異越顯著,篩選得到的差異表達(dá)基因越可靠。圖中綠色的點代表表達(dá)下調(diào)基因, 紅色的點代表表達(dá)上調(diào)基因, 黑色代表非差異表達(dá)基因。

點擊按鈕,獲取設(shè)計思路方案

百邁客云

關(guān)注百邁客云,隨時隨地學(xué)習(xí)

?
最近文章
免费黄色视频大全 | 99免费视频在线观看 | 欧美激情婬妇A片AAA毛多水多 | 亚洲AV无码专区一级婬片毛片 | 无码粉嫩小泬无套免费视频 | 蜜桃av网站在线浏览 | 国产精品久久久一级毛片 | 四川少妇BBBBB影院 | 懂色av粉嫩av蜜臀 | 国产精品一区在线观看 | 91丨国产丨白浆秘 3D动漫 | 中国女人的j 视频 污 | 韩国一级婬片A片AAA | 99午夜视频在线观看 | 日韩成人A片高潮猛叫农村妇女 | ▓成人蘑菇视频▓无码免费3D | 国产美女裸体无遮挡永久免费 | 中文字幕亚洲精品乱无码 | 红桃视频网址永久在线 | 在线观看黄色视频免费 | 夫妻黄录像a人片 | 无码精品人妻日韩A片下载 免费看AAAAA级少婬片 | EEUSS鲁片一区二区三区 | 国产精品jizz中国一级片 | 国产精品一二三区视频网站 | 福利姬M腿白浆一区二区 | 白丝校花自慰一区二区 | 少妇无码一区二区三区免费 | 无码在线免费观看视频 | 亚洲秘 无码一区二区三区 93人妻人人揉人人躁人人 | 精品国产AⅤ无码久久久暖暖 | 国产无码精品在线观看 | 91精品国产aⅴ一区二区 | 人妻无码久久一区二区免费麻豆 | 丰满人妻日本久久久久 | 亚婷婷洲AV久久蜜臀无码 | 国产成人精品无码免费播放精品 | 国产精品无码久久久久沙龙 | 69堂成人精品免费视频 | 三上悠亚一区二区三区 | 人人妻人人玩人人爽 |