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 分類: 醫(yī)學(xué)研究

導(dǎo)讀

腸道微生物群(GM)在形成系統(tǒng)性免疫反應(yīng)中發(fā)揮重要作用,并影響免疫檢查點抑制劑(ICI)的療效。接受ICI治療的患者抗生素(ATB)會導(dǎo)致臨床效果變差。然而,GM分析和基線ATB是否可以作為晚期非小細(xì)胞肺癌(NSCLC)的ICI療效的生物標(biāo)志物仍是未知的。作者前瞻性的收集了70例日本晚期NSCLC患者的基線(ICI前)糞便樣品和臨床數(shù)據(jù),并將抗PD-1/PD-L1抗體作為首次或難以治療的治療方法。對糞便樣品進行16S rRNA V3-V4區(qū)進行擴增子測序,并進行細(xì)菌多樣性和差異分析。臨床終點為客觀緩解率(ORR)、無進展生存期(PFS)、總生存期(OS)和免疫相關(guān)不良事件(irAE)。ORR為34%、PFS和OS中位數(shù)分別為5.2月和16.2個月。接受ICI前ATB治療的患者在基線時有較低的alpha多樣性和低豐度的Ruminococcaceae UCG 13和Agathobacter。在分析無ATB患者時,alpha多樣性與OS相關(guān)。此外,Ruminococcaceae UCG 13和Agathobacter在良好的ORR和PFS>6個月的患者中富集。Ruminococcaceae UCG 13在OS>12個月的患者中富集。在經(jīng)歷低級和高級別irAE的患者中GM存在差異。作者證明了ATB對GM組成的負(fù)面影響,并確定了對ICI有良好反應(yīng)的患者細(xì)菌庫。
?英文題目:The gut microbiome associates with immune checkpoint inhibition outcomes in patients with advanced non-small cell lung cancer

中文題目:晚期非小細(xì)胞肺癌患者腸道微生物與免疫檢查點抑制結(jié)果相關(guān)
發(fā)表期刊:Cancer Immunol Res
影響因子:8.728
發(fā)表時間:2020.7.27
作者:Taiki Hakozaki
單位:東京都市癌癥和傳染病中心小果美醫(yī)院
原文鏈接:https://cancerimmunolres.aacrjournals.org/content/8/10/1243.long
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材料與方法

試驗材料:70例晚期NSCLC患者糞便樣品
試驗方法:16S rRNA V3-V4區(qū)測序

實驗結(jié)果

1、患者基線特征

本研究納入了70例NSCLC患者,年齡中位數(shù)為70歲,所有患者均接受了抗PD-1/抗PD-L1單藥治療,50%的患者首次治療。隨訪時間中位數(shù)為9.7個月,16例(23%)患者在ICI開始前1個月接受ATB治療。

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2、所有患者的腸道微生物組成按存活率分層

作者檢測的隊列中所有患者alpha多樣性在OS>12個月和OS<12個月的患者之間差異不顯著。依據(jù)臨床數(shù)據(jù)比較了組間GM的組成。在PFS>6個月的患者中,Ruminococcaceae UCG 13 ?Agathobacter富集。在OS>12個月的患者中Lachnospiraceae UCG 001富集。

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3、所有患者的腸道微生物組成按ATB使用分層

作者研究了ATB對GM組成的影響。ATB的使用與Shannon和Inverse Simpson指數(shù)減少有關(guān)(圖1A)。在分析ATB和無ATB組beta多樣性時,聚類到兩個clusters(圖1B)。未接受ATB治療的患者糞便中富集Clostridia,尤其是Ruminococcaceae UCG 13、Clostridiales?和?Agathobacter(圖1C)。而接受ATB治療的患者糞便中富集Hungatella(圖1D)。

?圖1所有ICI治療的NSCLC患者腸道微生物組成按照抗生素使用分層

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4、無ATB患者的腸道微生物組成與與預(yù)后的關(guān)系

由于ATB的使用顯著改變了GM的組成,作者通過排除接受ATB治療的患者來描述GM組成。在無ATB組,alpha多樣性降低與較短的OS有關(guān)(圖2A)。在beta多樣性分析中沒有發(fā)現(xiàn)不同的clusters。Ruminococcaceae UCG 13Agathobacter在具有良好ORR和PFS>6個月的個體中富集(圖2B和2C)。Ruminococcaceae UCG 13在OS>12個月的患者中富集(圖2D)。在未接受ATB治療的患者中,Clostridiales order在OS>12個月的患者中富集(圖2D)。

GM含有和缺乏Ruminococcaceae UCG 13Agathobacter的NSCLC患者的Kaplan-Meier生存曲線顯著分開。在未接受ATB治療的患者中,Ruminococcaceae UCG 13存在與較長的OS和PFS有關(guān)(圖3A)。在未接受ATB治療的患者中,Agathobacter與較長的OS和PFS有關(guān)(圖3C)。所有患者中Ruminococcaceae UCG 13存在與較長的OS有關(guān)(圖3B)。所有患者中Agathobacter存在與較長的OS和FPS有關(guān)(圖3D)。多變量分析進一步證明了Ruminococcaceae UCG 13的存在與OS改善相關(guān)。而Agathobacter差異無統(tǒng)計學(xué)意義。

?圖2未接受抗生素治療的ICI治療的NSCLC患者腸道微生物組成與預(yù)后之間的關(guān)系

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?圖3 ICI治療的NSCLC患者Ruminococcaceae UCG 13Agathobacter?存在與否對總體生存率的分層

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5、腸道微生物組成與免疫相關(guān)不良事件的關(guān)系

考慮到GM與irAE之間的可能存在聯(lián)系,作者分析了經(jīng)歷臨床相關(guān)irAE的患者(>2級)和不嚴(yán)重的irAE患者(1級或無)之間的GM組成間的差異。在未接受ATB治療的患者和所有患者中,組間的細(xì)菌多樣性沒有差異。LEfSe分析中Lactobacillaceae和DESeq2分析中Raoultella?在未經(jīng)歷嚴(yán)重irAE患者糞便中富集(圖4A和4B)。盡管Akkermensia與改善的臨床結(jié)果無關(guān),但是其與較輕的irAE相關(guān)(圖4B)。

圖4 ?ICI治療的NSCLC患者腸道微生物組成與免疫相關(guān)不良事件之間的關(guān)系

總結(jié)

總之,作者證明了ATB對GM的組成的負(fù)面影響,并在良好的臨床效果或低級別irAE的患者中發(fā)現(xiàn)了不同的細(xì)菌庫。本文數(shù)據(jù)加強了開發(fā)診斷工具的重要性,該工具旨在識別腸道生態(tài)失調(diào),以預(yù)測晚期NSCLC患者接受ICI治療的耐藥性和irAE。許多問題仍未得到解答,包括腸道菌群是否影響癌癥發(fā)病率和嚴(yán)重程度、腫瘤組織學(xué)、腫瘤遺傳學(xué)、腫瘤微環(huán)境,以及治療方式、并發(fā)癥、共同藥物和地理分布是否可以改變腸道微生物。進一步對NSCLC患者糞便樣品進行前瞻性測序的工作正在進行中,以確定特異性和最低限度的GM特征與ICI治療有利和不利的臨床結(jié)果有關(guān)。

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