2016年-2021年空間轉(zhuǎn)錄組文章發(fā)表趨勢(shì)和影響因子分布

通過(guò)檢索空間轉(zhuǎn)錄組發(fā)表文章的數(shù)據(jù)分析來(lái)看，該技術(shù)在2021年中得到廣泛應(yīng)用，并且文章影響因子主要集中在10~20分區(qū)間，其占比高達(dá)39%，其次在30分以上占比達(dá)到30%，由此可見(jiàn)空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)的應(yīng)用極大提升了文章的質(zhì)量和檔次。

不僅如此，2021年空間轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)還在物種上有了新的突破，不再局限于人和鼠常見(jiàn)的模式物種，已經(jīng)開(kāi)始邁入哺乳動(dòng)物（豬）、家禽類（雞）、植物類（擬南芥、云杉、楊樹(shù)）等新的物種領(lǐng)域，極大拓展其應(yīng)用范圍。

物種空間轉(zhuǎn)錄組文獻(xiàn)發(fā)表統(tǒng)計(jì)

2021年空間轉(zhuǎn)錄組在不同組織部位上應(yīng)用也取得一些新進(jìn)展：比如骨組織一類就有不少文章發(fā)表，有頭蓋骨[PNAS，IF=11.2]、腰骨骼肌[NatureCommunications，IF=14.9]、肩部肌腱[AnnRheum Dis，IF=19.1 ]；生殖器官有子宮內(nèi)膜[Nat Genet，IF=27.6]、卵巢[NatureBiotechnology，IF=54.9]；泌尿系統(tǒng)：前列腺[Nature Communications，IF=14.9]、膀胱[NatureCommunications，IF=14.9]；腸道組織：胎兒腸道[Cell，IF=41.6]；脂肪組織：皮下腹部[CellMetabolism，IF=27.3]；腦組織：腦內(nèi)炎癥[[Ann Rheum Dis，IF=19.1 ]，IF=24.9]、等皮質(zhì)和海馬[Cell，IF=41.6]、腦神經(jīng)系統(tǒng)[AnnuRev Neurosci，IF=12.4]、前額葉皮層[Nat Neurosci，IF=24.9]、海馬和前額葉皮質(zhì)[NatureCommunications，IF=14.9]等都組織區(qū)域都有不錯(cuò)的研究報(bào)道，甚至連取材最困難的皮膚樣本都發(fā)表重要研究成果：皮膚肉芽腫[Nature Immunology ，IF=25.6]，空間轉(zhuǎn)錄組逐漸在更多的組織類型上得到廣泛的應(yīng)用，揭示更深層次空間維度生物學(xué)表型。

空間轉(zhuǎn)錄組不同組織應(yīng)用發(fā)表文獻(xiàn)統(tǒng)計(jì)

基于上面數(shù)據(jù)我們不難看出來(lái)前期研究，腦組織空間基因表達(dá)探索最為廣泛，當(dāng)然還有心臟組織、肝組織前列腺組織；植物主要集中在花序器官的研究，隨著各種組織探索和嘗試，基本上空間轉(zhuǎn)錄組已經(jīng)在各種組織中全面開(kāi)火，不管從技術(shù)的前瞻性也好，還是從空間這個(gè)維度深度闡釋一些生物學(xué)現(xiàn)象，彌補(bǔ)了細(xì)胞空間位置信息的趨勢(shì)，空間多組學(xué)技術(shù)毫無(wú)疑問(wèn)成為引領(lǐng)科學(xué)研究的風(fēng)向標(biāo)。

后續(xù)文章，敬請(qǐng)關(guān)注：

2021年度空間轉(zhuǎn)錄組動(dòng)植物四大應(yīng)用方向：時(shí)空?qǐng)D譜篇（發(fā)育）、腫瘤篇、疾病機(jī)制篇、生物進(jìn)化篇